Segunda película sobre el personaje marino más querido por niños y adultos, Bob Esponja. El argumento gira en torno a Bob Esponja y sus inseparables amigos del mar, como son Patricio y la ardilla Arenita, y otros personajes de la serie en la que se basa, como Calamardo y Don Cangrejo. En esta ocasión Bob Esponja y cía se embarcan en una aventura en la que deberán encontrar una receta robada, lo que llevará a los personajes de Fondo Bikini hasta nuestra dimensión. Por lo que la película mezcla animación y escenas de acción real. Las escenas de animación están hechas tanto con CGI (imagen generada por ordenador) como en dibujo a mano. En la dimensión real se tendrán que enfrentar al pirata Alameda Jack, al que da vida Antonio Banderas.

Evil pirate Burger Beard is in search of the final page of a magical book that makes any evil plan he writes in it come true, but the final page happens to be the Krabby Patty secret formula. When Burger Beard endangers Bikini Bottom, SpongeBob, Patrick, Mr. Krabs, Squidward, Sandy, and Plankton must embark on a quest to retrieve the recipe and save their city...a quest that takes them to the surface world and transforms them into superheroes.